華人科學(xué)家揭示2019-nCoV的潛在T細(xì)胞和B細(xì)胞表位

來(lái)源：米內(nèi)網(wǎng)       點(diǎn)擊量：5376      時(shí)間：2020-02-27

截至2020年2月26日，2019-nCoV已經(jīng)感染了超過(guò)26個(gè)國(guó)家的超過(guò)77000人，奪走了超過(guò)2000條生命。2019-nCoV是一種引起COVID-19的新型冠狀病毒，與SARS-CoV有很高的相似性。目前還沒(méi)有針對(duì)2019-nCoV或任何形式的冠狀病毒的疫苗被批準(zhǔn)。

圖片來(lái)源：bioRxiv

近日來(lái)自斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Chen Binbin和Ethan Fast在預(yù)印本網(wǎng)站bioRxiv上發(fā)表了一篇尚未經(jīng)過(guò)同行評(píng)議的最新文章，題為"Potential T-cell and B-cell Epitopes of 2019-nCoV"。在該文章中，研究人員使用來(lái)自結(jié)構(gòu)生物學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí)的計(jì)算工具來(lái)識(shí)別基于病毒蛋白抗原和抗體結(jié)合特性的2019-nCoV 的T細(xì)胞和B細(xì)胞表位。這些表位可用于開(kāi)發(fā)更有效的疫苗和鑒定中和抗體。

研究人員在人類MHC-I和MHC-II等位基因中鑒定了405個(gè)抗原表達(dá)分?jǐn)?shù)良好的病毒肽，并在2019-nCoV S蛋白受體結(jié)合域附近發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)潛在的中和性B細(xì)胞表位(440-460和494-506)。通過(guò)分析來(lái)自四大洲的68個(gè)病毒基因組的突變譜，研究人員發(fā)現(xiàn)了96個(gè)編碼突變。這些突變更可能發(fā)生在MHC-I表現(xiàn)評(píng)分較好的區(qū)域(p=0.02)。在S蛋白受體結(jié)合區(qū)附近不存在突變。最后，研究人員用SARS-CoV實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)來(lái)驗(yàn)證了我們的計(jì)算方法。